BioJavaDomainModel: org.biojavax.bio.class.violet

File org.biojavax.bio.class.violet, 13.0 KB (added by r.bruskiewich, 10 years ago)

org.biojavax.bio Violet UML file

Line 
1<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
2<java version="1.6.0_04" class="java.beans.XMLDecoder"> 
3 <object class="com.horstmann.violet.ClassDiagramGraph">
4  <void method="addNode">
5   <object id="InterfaceNode0" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
6    <void property="bounds">
7     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
8      <void method="setRect">
9       <double>310.0</double>
10       <double>100.0</double>
11       <double>140.0</double>
12       <double>100.0</double>
13      </void>
14     </object>
15    </void>
16    <void property="methods">
17     <void property="text">
18      <string>getRank():int
19setRank(int rank)
20</string>
21     </void>
22    </void>
23    <void property="name">
24     <void property="text">
25      <string>«interface»
26BioEntryRelationship</string>
27     </void>
28    </void>
29   </object>
30   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
31    <void method="setLocation">
32     <double>310.0</double>
33     <double>100.0</double>
34    </void>
35   </object>
36  </void>
37  <void method="addNode">
38   <object id="InterfaceNode1" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
39    <void property="bounds">
40     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
41      <void method="setRect">
42       <double>40.0</double>
43       <double>120.0</double>
44       <double>160.0</double>
45       <double>60.0</double>
46      </void>
47     </object>
48    </void>
49    <void property="name">
50     <void property="text">
51      <string>«interface»
52org.biojavax.ontology.Term</string>
53     </void>
54    </void>
55   </object>
56   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
57    <void method="setLocation">
58     <double>40.0</double>
59     <double>120.0</double>
60    </void>
61   </object>
62  </void>
63  <void method="addNode">
64   <object id="InterfaceNode2" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
65    <void property="bounds">
66     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
67      <void method="setRect">
68       <double>570.0</double>
69       <double>280.0</double>
70       <double>140.0</double>
71       <double>160.0</double>
72      </void>
73     </object>
74    </void>
75    <void property="methods">
76     <void property="text">
77      <string>getName():String
78getAccession():String
79getIdentifier():String
80getDivision():String
81getDescription():String
82getVersion():int</string>
83     </void>
84    </void>
85    <void property="name">
86     <void property="text">
87      <string>«interface»
88BioEntry</string>
89     </void>
90    </void>
91   </object>
92   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
93    <void method="setLocation">
94     <double>570.0</double>
95     <double>280.0</double>
96    </void>
97   </object>
98  </void>
99  <void method="addNode">
100   <object id="NoteNode0" class="com.horstmann.violet.NoteNode">
101    <void property="bounds">
102     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
103      <void method="setRect">
104       <double>170.0</double>
105       <double>40.0</double>
106       <double>140.0</double>
107       <double>40.0</double>
108      </void>
109     </object>
110    </void>
111    <void property="bounds">
112     <void method="setRect">
113      <double>170.0</double>
114      <double>40.0</double>
115      <double>140.0</double>
116      <double>40.0</double>
117     </void>
118    </void>
119    <void property="text">
120     <void property="text">
121      <string>should &quot;term&quot; be &quot;type&quot;?</string>
122     </void>
123    </void>
124   </object>
125   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
126    <void method="setLocation">
127     <double>170.0</double>
128     <double>40.0</double>
129    </void>
130   </object>
131  </void>
132  <void method="addNode">
133   <object id="PointNode0" class="com.horstmann.violet.PointNode">
134    <void property="bounds">
135     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
136      <void method="setRect">
137       <double>209.0</double>
138       <double>130.0</double>
139       <double>0.0</double>
140       <double>0.0</double>
141      </void>
142     </object>
143    </void>
144    <void property="bounds">
145     <void method="setRect">
146      <double>209.0</double>
147      <double>130.0</double>
148      <double>0.0</double>
149      <double>0.0</double>
150     </void>
151    </void>
152   </object>
153   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
154    <void method="setLocation">
155     <double>209.0</double>
156     <double>130.0</double>
157    </void>
158   </object>
159  </void>
160  <void method="addNode">
161   <object id="InterfaceNode3" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
162    <void property="bounds">
163     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
164      <void method="setRect">
165       <double>960.0</double>
166       <double>60.0</double>
167       <double>160.0</double>
168       <double>60.0</double>
169      </void>
170     </object>
171    </void>
172    <void property="name">
173     <void property="text">
174      <string>«interface»
175org.biojavax.Namespace</string>
176     </void>
177    </void>
178   </object>
179   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
180    <void method="setLocation">
181     <double>960.0</double>
182     <double>60.0</double>
183    </void>
184   </object>
185  </void>
186  <void method="addNode">
187   <object id="InterfaceNode4" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
188    <void property="bounds">
189     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
190      <void method="setRect">
191       <double>960.0</double>
192       <double>190.0</double>
193       <double>100.0</double>
194       <double>60.0</double>
195      </void>
196     </object>
197    </void>
198    <void property="name">
199     <void property="text">
200      <string>«interface»
201taxa.NCBITaxon</string>
202     </void>
203    </void>
204   </object>
205   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
206    <void method="setLocation">
207     <double>960.0</double>
208     <double>190.0</double>
209    </void>
210   </object>
211  </void>
212  <void method="addNode">
213   <object id="InterfaceNode5" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
214    <void property="bounds">
215     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
216      <void method="setRect">
217       <double>960.0</double>
218       <double>330.0</double>
219       <double>100.0</double>
220       <double>60.0</double>
221      </void>
222     </object>
223    </void>
224    <void property="name">
225     <void property="text">
226      <string>«interface»
227RankedDocRef</string>
228     </void>
229    </void>
230   </object>
231   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
232    <void method="setLocation">
233     <double>960.0</double>
234     <double>330.0</double>
235    </void>
236   </object>
237  </void>
238  <void method="addNode">
239   <object id="InterfaceNode6" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
240    <void property="bounds">
241     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
242      <void method="setRect">
243       <double>960.0</double>
244       <double>470.0</double>
245       <double>140.0</double>
246       <double>60.0</double>
247      </void>
248     </object>
249    </void>
250    <void property="name">
251     <void property="text">
252      <string>«interface»
253org.biojavax.Comment</string>
254     </void>
255    </void>
256   </object>
257   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
258    <void method="setLocation">
259     <double>960.0</double>
260     <double>470.0</double>
261    </void>
262   </object>
263  </void>
264  <void method="addNode">
265   <object id="InterfaceNode7" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
266    <void property="bounds">
267     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
268      <void method="setRect">
269       <double>960.0</double>
270       <double>610.0</double>
271       <double>120.0</double>
272       <double>60.0</double>
273      </void>
274     </object>
275    </void>
276    <void property="name">
277     <void property="text">
278      <string>«interface»
279RankedCrossRef</string>
280     </void>
281    </void>
282   </object>
283   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
284    <void method="setLocation">
285     <double>960.0</double>
286     <double>610.0</double>
287    </void>
288   </object>
289  </void>
290  <void method="addNode">
291   <object id="InterfaceNode8" class="com.horstmann.violet.InterfaceNode">
292    <void property="bounds">
293     <object class="java.awt.geom.Rectangle2D$Double">
294      <void method="setRect">
295       <double>960.0</double>
296       <double>730.0</double>
297       <double>100.0</double>
298       <double>60.0</double>
299      </void>
300     </object>
301    </void>
302    <void property="name">
303     <void property="text">
304      <string>«interface»
305Annotation</string>
306     </void>
307    </void>
308   </object>
309   <object class="java.awt.geom.Point2D$Double">
310    <void method="setLocation">
311     <double>960.0</double>
312     <double>730.0</double>
313    </void>
314   </object>
315  </void>
316  <void method="connect">
317   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
318    <void property="bentStyle">
319     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HVH"/>
320    </void>
321    <void property="endArrowHead">
322     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
323    </void>
324    <void property="endLabel">
325     <string>term</string>
326    </void>
327   </object>
328   <object idref="InterfaceNode0"/>
329   <object idref="InterfaceNode1"/>
330  </void>
331  <void method="connect">
332   <object class="com.horstmann.violet.NoteEdge"/>
333   <object idref="NoteNode0"/>
334   <object idref="PointNode0"/>
335  </void>
336  <void method="connect">
337   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
338    <void property="bentStyle">
339     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HV"/>
340    </void>
341    <void property="endArrowHead">
342     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
343    </void>
344    <void property="endLabel">
345     <string>subject</string>
346    </void>
347   </object>
348   <object idref="InterfaceNode0"/>
349   <object idref="InterfaceNode2"/>
350  </void>
351  <void method="connect">
352   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
353    <void property="bentStyle">
354     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="VH"/>
355    </void>
356    <void property="endArrowHead">
357     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
358    </void>
359    <void property="endLabel">
360     <string>object</string>
361    </void>
362   </object>
363   <object idref="InterfaceNode0"/>
364   <object idref="InterfaceNode2"/>
365  </void>
366  <void method="connect">
367   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
368    <void property="bentStyle">
369     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HVH"/>
370    </void>
371    <void property="endArrowHead">
372     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
373    </void>
374    <void property="endLabel">
375     <string>namespace</string>
376    </void>
377   </object>
378   <object idref="InterfaceNode2"/>
379   <object idref="InterfaceNode3"/>
380  </void>
381  <void method="connect">
382   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
383    <void property="bentStyle">
384     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HVH"/>
385    </void>
386    <void property="endArrowHead">
387     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
388    </void>
389    <void property="endLabel">
390     <string>taxon</string>
391    </void>
392   </object>
393   <object idref="InterfaceNode2"/>
394   <object idref="InterfaceNode4"/>
395  </void>
396  <void method="connect">
397   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
398    <void property="bentStyle">
399     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HVH"/>
400    </void>
401    <void property="endArrowHead">
402     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
403    </void>
404    <void property="endLabel">
405     <string>RankedDocRef *</string>
406    </void>
407   </object>
408   <object idref="InterfaceNode2"/>
409   <object idref="InterfaceNode5"/>
410  </void>
411  <void method="connect">
412   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
413    <void property="bentStyle">
414     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HVH"/>
415    </void>
416    <void property="endArrowHead">
417     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
418    </void>
419    <void property="endLabel">
420     <string>comment*</string>
421    </void>
422   </object>
423   <object idref="InterfaceNode2"/>
424   <object idref="InterfaceNode6"/>
425  </void>
426  <void method="connect">
427   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
428    <void property="bentStyle">
429     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HVH"/>
430    </void>
431    <void property="endArrowHead">
432     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
433    </void>
434    <void property="endLabel">
435     <string>rankedCrossRef *</string>
436    </void>
437   </object>
438   <object idref="InterfaceNode2"/>
439   <object idref="InterfaceNode7"/>
440  </void>
441  <void method="connect">
442   <object class="com.horstmann.violet.ClassRelationshipEdge">
443    <void property="bentStyle">
444     <object class="com.horstmann.violet.BentStyle" field="HVH"/>
445    </void>
446    <void property="endArrowHead">
447     <object class="com.horstmann.violet.ArrowHead" field="V"/>
448    </void>
449    <void property="endLabel">
450     <string>annotation</string>
451    </void>
452   </object>
453   <object idref="InterfaceNode2"/>
454   <object idref="InterfaceNode8"/>
455  </void>
456 </object>
457</java>